? ? ? ? 2020年1月7日,北京博奧晶典生物技術有限公司單細胞免疫組庫測序技術榮獲10x Genomics公司頒發(fā)的CSP證書,這是繼單細胞轉錄組測序、單細胞ATAC測序技術之后博奧晶典獲得的又一官方認證,是全國唯一一家同時擁有三種單細胞測序技術官方認證的服務商。為2019年畫上圓滿句號的同時,開啟了2020年單細胞測序服務的新篇章。
? ? ? ? 作為國內首批引進10x Genomics單細胞平臺的公司,博奧晶典現已完成幾千個樣本的單細胞測序實驗。涵蓋了單細胞轉錄組、單細胞免疫組庫、單細胞ATAC、單細胞蛋白等多種分子水平的單細胞服務實驗。涉及的研究領域包括腫瘤、免疫、發(fā)育、神經、再生等。
? ? ? ??博奧晶典擁有系統(tǒng)完善的單細胞測序服務平臺,可提供單細胞多組學服務,為單細胞水平闡述生物體中心法則和調控機制提供了有力的工具。
單細胞轉錄組測序? ? ? ? 單細胞轉錄組測序可以在單細胞水平分析基因表達,研究細胞的異質性,定義細胞類型,識別細胞狀態(tài),探索新的細胞亞群和稀有細胞群,具有廣泛的應用潛力。
圖1 細胞分群圖(左)? ? ?? 圖2 擬時間序列圖(右)
單細胞免疫組庫測序
? ? ? ? 單細胞免疫組庫作為探索生物體免疫細胞多樣性變化的技術,可探索腫瘤免疫微環(huán)境,識別和抵御身體外部的入侵者,描述腫瘤發(fā)生機制,輔助免疫治療;探索自身免疫疾病和炎癥性疾病機制,輔助疫苗研究;揭示器官移植帶來的排斥反應,為排異藥物研究提供幫助,是腫瘤和免疫疾病研究的有力工具。
圖3?B細胞克隆型注釋(左)? ? ? ?圖4?多樣本比較分析(右)
單細胞ATAC測序
? ? ? ? 單細胞ATAC作為表觀遺傳學研究技術手段,可用于繪制單細胞基因組染色質開放區(qū)的圖譜,在單細胞水平研究基因調控區(qū)。結合單細胞轉錄組數據探索基因的轉錄調控機制,進一步闡述生物現象發(fā)生變化的原因。
圖5?細胞群預測(左)? ? ? ? 圖6?轉錄調控機制(右)
單細胞蛋白測序
? ? ? ? 單細胞蛋白測序技術可以同時獲得單細胞層面的蛋白和基因表達信息。由于基因與蛋白的表達不一致,了解基因調控和單細胞異質性需要有關RNA和蛋白表達的信息。利用單細胞轉錄組+蛋白組進行多維組學研究,不僅可以提高解析度,而且兩個維度相互驗證,使實驗結果更具說服力。
圖7 單細胞蛋白實驗原理
? ? ? ? 截止目前,博奧晶典單細胞平臺已支持客戶發(fā)表7篇高水平文章,累計影響因子79.472分,是國內單細胞平臺支持發(fā)表文章數目最多,影響因子最高的企業(yè)。成功制備50多種組織類型的單細胞懸液,覆蓋的物種和樣品類型包括人和小鼠的肝臟、肺臟、皮膚、心臟、腦、腎臟、血液、卵巢、神經,以及雞、斑馬魚、豬、水稻、擬南芥、油菜、白菜、橄欖等。博奧晶典于2018年9月與BD(中國)成立單細胞研究聯合實驗室,致力于大規(guī)模單細胞測序產品的開發(fā)和打磨,目前可開展如下單細胞測序產品的服務。